Pratikno aktif di berbagai organisasi profesional diantaranya Asosiasi Ilmu Politik Indonesia, Masyarakat Ilmu Pemerintahan Indonesia dan Asian Consortium for Political Research (ACPR).
Pada tahun 2010, dia aktif sebagai panelis dalam beberapa kegiatan akademik seperti International Research Workshop and PhD Course on “Transformative Politics” in University of Oslo, Norwegia dan the 6th EuroSEAS (The European Association for South‐East Asian Studies) Conference “Indonesian Democracy in Comparative Perspective”, the School of Global Studies, University Of Gothenburg, Swedia.
Tahun 2008 ia bersama Purwo Santoso, Cornelis Lay dan AAGN Ari Dwipayana menyusun Monograf Keistimewaan Yogyakarta.
(Dani Jumadil Akhir)