Karena kromosom X mengandung banyak gen yang berhubungan dengan perkembangan otak, muncul teori bahwa kecerdasan lebih banyak diturunkan dari ibu. Meski demikian, para ahli menegaskan bahwa hubungan antara kromosom X dan IQ tidak sesederhana itu.
Menurut peneliti David H. Skuse, gen-gen yang terdapat pada kromosom X memang berperan dalam perkembangan fungsi otak. Namun, gen tersebut bukan satu-satunya faktor yang menentukan tingkat kecerdasan seseorang.
Selain itu, anak perempuan juga memperoleh kromosom X dari ayah. Sementara pada anak laki-laki, meski kromosom X berasal dari ibu, perkembangan kecerdasan tetap dipengaruhi oleh banyak gen lain yang diwariskan dari kedua orang tua.
Dengan kata lain, baik ayah maupun ibu sama-sama berkontribusi terhadap potensi kecerdasan anak.
Berbagai penelitian menunjukkan bahwa faktor genetik berkontribusi sekitar 50 persen terhadap variasi kecerdasan antarindividu. Sementara itu, sisanya dipengaruhi oleh berbagai faktor lingkungan yang mendukung perkembangan otak.