Dalam regional Indonesia, Universitas Gadjah Mada menjadi peringkat pertama. Adapun posisi kedua diduduki Universitas Indonesia (UI) dan posisi ketiga diduduki Institut Teknologi Bandung (ITB).
Berikut 100 daftar lengkap perguruan tinggi terbaik di Indonesia dikutip dari laman webometrics, Kamis (7/2/2019) :
1. Universitas Gadjah Mada
2. Universitas Indonesia
3. Institut Teknologi Bandung
4. Institut Pertanian Bogor
5. Universitas Diponegoro
6. Universitas Brawijaya
7. Institut Teknologi Sepuluh November
8. Universitas Sebelas Maret Surakarta
9. Universitas Syiah Kuala
10. Universitas Padjajaran Bandung
11. Universitas Telkom
12. Universitas Airlangga
13. Universitas Pendidikan Indonesia
14. Universitas Hasanuddin
15. Universitas Lampung
16. Universitas Andalas
17. Universitas Jember
18. Universitas Sumatera Utara
19. Universitas Mataram
20. Universitas Jenderal Soedirman
21. Universitas Tadulako
22. Universitas Riau
23. Universitas Negeri Yogyakarta
24. Universitas Binus Nusantara
25. Universitas Mercu Buana
26. Universitas Sriwijaya
27. Universitas Narotama UNNAR Surabaya
28. Universitas Halu Oleo Kendari
29. Universitas Dian Nuswantoro
30. Universitas Katolik Parahyangan
31. Universitas Udayana
32. Universitas Gunadarma
33. Universitas Negeri Surabaya
34. Universitas Sam Ratulangi
35. Universitas Bengkulu
36. Universitas Islam Indonesia
Baca Juga: 7 Tanda Orang Pintar, Ternyata Semuanya Tidak Disadari
37. Universitas Katolik Indonesia Atma Jaya
38. Universitas Muhammadiyah Yogyakarta
39. Universitas Jambi
40. Universitas Negeri Malang
41. Universitas Surabaya
42. Universitas Islam Negeri UIN Syarif Hidayatullah Jakarta
43. Akademi Telkom Jakarta
44. Politeknik Elektronika Negeri Surabaya
45. Petra Christian University
46. Universitas Islam Negeri UIN Maulana Malik Ibrahim Malang
47. Universitas Muhammadiyah Surakarta
48. Universitas Islam Negeri UIN Sultan Syarif Kasim Riau
49. Universitas Pasundan Bandung
50. Universitas Islam Negeri UIN Sunan Gunung Djati Bandung
51. Universitas Negeri Semarang
52. Universitas Kristen Satya Wacana
53. Universitas Sanata Dharma USD Sleman
54. Universitas Jenderal Achmad Yani
55. Universitas Muhammadiyah Malang
56. Universitas Negeri Makassar
57. Universitas Pendidikan Ganesha
58. Institut Sains dan Teknologi AKPRIND Yogyakarta
59. Universitas Mulawarman
60. Universitas Negeri Padang
61. Universitas Islam Negeri UIN Walisongo Semarang
62. Universitas Terbuka
63. Politeknik Negeri Ujung Pandang
64. Universitas Semarang
65. Poltekkes Kemenkes Malang
66. Universitas Islam Negeri UIN Sunan Kalijaga Yogyakarta
67. Universitas Islam Sultan Agung Semarang
68. Universitas Islam Negeri UIN Alauddin Makassar
69. Institut Pemerintahan Dalam Negeri IPDN
70. Universitas Islam Negeri UIN Sunan Ampel Surabaya
71. Universitas Palangka Raya
72. Universitas Tribhuwana Tunggadewi
73. Politeknik Negeri Pontianak
74. Universitas Medan Area
75. Universitas Maritim Raja Ali Haji
76. Universitas Muhammadiyah Semarang
77. Institut Seni Indonesia Surakarta
78. Universitas Muhammadiyah Jakarta
79. Universitas Widyatama UTAMA Bandung
80. Universitas Paramadina
81. Universitas Pelita Harapan
82. Universitas Muhammadiyah Surabaya
83. Universitas Ahmad Dahlan Yogyakarta
84. Institut Informatika dan Bisnis Darmajaya
85. Indonesian Computer University UNIKOM
86. Universitas Atma Jaya Yogyakarta
87. Poltekkes Jakarta II
88. Universitas Muhammadiyah Purwokerto
89. Universitas Pattimura
90. Poltekkes Palembang
91. Universitas Darma Persada UNSADA
92. Universitas YARSI
93. Universitas 17 Agustus 1945 UNTAG Surabaya
94. Universitas Malikussaleh
95. Universitas Negeri Gorontalo
96. Institut Seni Indonesia Yogyakarta Bantul
97. Universitas Tanjungpura
98. Sekolah Tinggi Agama Islam Negeri STAIN Pamekasan
99. Universitas Muhammadiyah Metro
100. Universitas Bina Dharma
