SMA Taruna Nusantara berada di kota Magelang dengan menempati lahan seluas 1,85 hektar diatas tanah milik Akademi Militer dan berlokasi tidak jauh dari Akademi Militer. Pada lokasi tersebut, SMA Taruna Nusantara memiliki fasilitas meliputi komplek akademis, asrama untuk siswa, dan kompleks perumahan untuk pamong beserta guru.
SMA Taruna Nusantara ini menggunakan kurikulum yang dibuat oleh Kementerian Pendidikan. Namun terdapat beberapa perbedaan mencolok yang membuatnya kerap disebut sebagai sekolah semi militer.
Kendati merupakan sekolah berbasis semi militer, namun SMA Taruna Nusantara tidak dibina langsung oleh TNI. Melainkan dibina oleh Lembaga Perguruan Taman Taruna Nusantara (LPTTN) dibawah Yayasan Pengembangan Potensi Sumber Daya Pertahanan (YPPSDP). LPTTN sendiri merupakan lembaga yang dibentuk dari kerjasama antara ABRI dan Taman Siswa.